В ряде случаев недооценивается тяжесть состояния больных и несвоевременно осуществляется диагностика острых заболеваний, что ведет к необоснованным отказам в выдаче больничных листков, запоздалому началу лечения, а в последующем — к длительным срокам временной нетрудоспособности или к инвалидности. Иногда, наоборот, переоценивается тяжесть состояния (болевого синдрома, стадии гипертонической болезни, степени выраженности недостаточности кровообращения и т. д.), а отсюда — необоснованные выдачи больничного листка, предоставления ограничений в работе.

К показателям второй- группы относятся:
• обоснованность решения вопроса об установлении признаков временной нетрудоспособности и отказов в выдаче больничных листков, а также других документов о временной нетрудоспособности. Здесь имеет значение правильность и полнота обоснования в медицинской документации принятых экспертных решений;
• правильность выдачи документов о временной нетрудоспособности;
• точность определения оптимальных сроков временной нетрудоспособности;
• правильность и своевременность выдачи врачебно-консультационной комиссией рекомендаций по временному трудовому устройству больных после перенесенного заболевания или травмы, а также по постоянному их трудоустройству в случаях, если заболевание становится хроническим;
• своевременность и обоснованность направления больных на освидетельствование во ВТЭК
Наконец, третья группа показателей включает в себя:
• планы работы по экспертизе временной нетрудоспособности (год, квартал) и их выполнение;
• выполнение должностными лицами лечебно-профилактических учреждений своих функциональных обязанностей по экспертизе;
• организацию работы по повышению квалификации врачей лечебно-профилактических учреждений по вопросам экспертизы временной нетрудоспособности (регулярность проведения конференций по данным вопросам, вводный инструктаж по экспертизе временной нетрудоспособности, наличие в лечебно-профилактическом учреждении нормативных материалов и учебно-методических пособий и др.);
• учет и хранение больничных листков;
• организацию работы врачебно-консультационной комиссии: лично ли лечащий врач представляет больных, обеспечивает ли врачебно-консультационная комиссия клинико-экспертные консультации; график ее работы (вечерние часы, предпраздничные дни и субботы), порядок приема больных, организация выездных заседаний врачебно-консультационной комиссии;
• связь врачебно-консультационной комиссии с врачебно-трудовыми экспертными комиссиями;
• анализ писем и жалоб трудящихся.

В лечебно-профилактических учреждениях основными методами контроля являются: личные осмотры больных, присутствие проверяющих на амбулаторном приеме, проверка соблюдения больными режима, предписанного врачом, контроль первичной медицинской документации (историй болезни, книг регистрации выдачи листков нетрудоспособности формы № 36, «фишек» — талонов на получение больничных листков и др.). Используется также метод экспертных оценок правильности оформления больничных листков.